МБОУ «Лицей №3» является пилоткой школой по внедрению федеральных государственных новых образовательных стандартов второго поколения (ФГОС НОО) на основании приказов:
◦ Приказ МОН КБР № 273 от 08.04.2010 «Об организации отработки государственного образовательного стандарта начального общего образования (ФГОС) на территории муниципальных образований КБР» (приказ находится в ведении МУ образования администрации городского округа Прохладный КБР)